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CCA (Canonical Correlation Analysis) の例 (R, CCA パッケージを使用)

前準備

R システムのインストール

【関連する外部ページ】

R システムの CRAN の URL: https://cran.r-project.org/

CCA パッケージのインストール

R システムで，次のコマンドを実行し，インストールする．

このとき「Secure CRAN mirrors」のような，ミラーサイトの選択画面が出たときは「Japan」のものを選ぶ． 

install.packages("CCA")

この操作でインストールが行われる． R システムのパッケージのインストールについては、 必要に応じて「R システムでのパッケージのインストール」のページを参考にしてください．

使ってみる

  1. R の起動
  2. library(CCA) の実行 
    library(CCA)
  3. データの準備，

    ここでは，iris を使う． 

    data(iris)
a <- iris[1:4]
  4. データの統計情報 
    stats(a)
  5. correlation

    下記の操作手順例では、ベクトルのデータ X とベクトルのデータ Y の correlation を求めている 

    X <- a[,1:2]
Y <- a[,3:4]
matcor(X, Y)
  6. CCA の計算

    cc1[1] は canonical correlations, cc1[3:4] は canonical coefficients 

    cc1 <- cc(X,Y)
cc1[1]
cc1[3:4]
  7. canonical loadings の計算 
    cc2 <- comput(X, Y, cc1)
cc2[3:6]